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故事发生在一个虚构的世界“庭园”之中，神秘的力量令一部分的人类获得了特异功能，“圣战天使”是传说中早已经失落的种族，他们能够变身成为超强的武器，通过和人类的合作进行战斗，如今，这一种族竟然渐渐开始了复

在同伴的眼中，瓜生新吾（水岛大宙 配音）是一个乐于助人的好好先生，而今年，新吾所就读的各务台私立学园即将和当地有名的结姬私立女子学园合并，而包括新吾在内的数十名学生，则被预先送往女校习惯未来的学习生活